热力学第三定律和质能守恒定律是否矛盾
不矛盾，你的理解是有点错误的。
首先，热寂不是热力学第三定律推出来的，而是热力学第二定律，该定律描述的是不可能把热从低温物体传到高温物体而不产生其他影响，或不可能从单一热源取热使之完全转换为有用的功而不产生其他影响，或不可逆热力过程中熵的微增量总是大于零。
当然，热寂的提出还有其他理论的支持，其中就有能量守恒。
能量守恒或质能守恒：能量无法创生或消失，它只能从一个形式转化成另一个形式，一个系统的总能量不变。
通过这写个定律我们推出来宇宙最终可能是热寂，而热寂的本质也不是消耗，热寂专业的描述是这样的：宇宙的能量保持不变，宇宙的熵将趋于极大值，伴随着这一进程，宇宙进一步变化的能力越来越小，一切机械的、物理的、化学的、生命的等多种多样的运动逐渐全部转化为热运动，最终达到处处温度相等的热平衡状态，这时一切变化都不会发生，宇宙处于死寂的永恒状态。
所以：
1.宇宙能量守恒，
2.宇宙的熵不会减少。那么将得到，宇宙的熵终将达到极大值，即宇宙将最终达到热平衡，称热寂。
（这一段来自百度）
从百科的介绍可以看出热寂的本质不是“消耗”，而是平衡，它的所有的用词都用的转化，所以热寂它考虑的是平衡、最小、守恒的思想。
首先一点，题主混淆了热力学第二和第三定律。热力学第三定律表明，完美晶体的熵在绝对零度时等于零，或者说温度无法降低到绝对零度（0K或-273.15 ℃）。
事实上，宇宙的演化与热力学第二定律有关。根据该定律，孤立系统的熵只会自发地增加而不会减少，这意味着系统的有序度变得越来越低，混乱度逐渐升高，有用能逐渐消耗。如果整个宇宙是一个孤立系统，那么，由于熵增原理，宇宙的熵将会自发地逐渐增加。
随着时间的推移，空间不断膨胀，宇宙的混乱度逐渐增加。与此同时，宇宙中的有用能也会逐渐消耗。例如，恒星通过核聚变产生热量，这个过程是不可逆的，不能再让这些能量回到恒星中，所以宇宙中的有用能会变得越来越少。但在此过程中，质能总和是守恒的，只是改变了形式而已，这与质能守恒并不矛盾。因为宇宙是一个孤立系统，并没有与外界存在联系，所以能量没有耗散掉，只是变得无用。
经历漫长的时间之后，宇宙所有天体不再发光，就连黑洞也会蒸发掉，粒子也会衰变，宇宙将会达到最低能量状态，即整个宇宙达到热力学平衡。那时不再会有能量的交换，一切活动完全停止，宇宙的熵增加到最大，这就是热寂的结局。
